Для использования файлового менеджера webmin+virtualmin прейдите на нужный домен, File Manager, после перехода вы сразу попадете в корневую директорию домена
3. Что бы использовать текстовый редактор для правки файлов, выберите нужный файл, нажмите на 3 точки возле меню с галкой, и выпадит меню